在所有的糟渣資源中，豆渣算是營養價值較好的糟渣之一，其蛋白品質好，消化吸收率高，折干的粗蛋白含量達到24%左右，粗纖維含量6%左右，富含氨基酸，特別是賴氨酸含量豐富，但也有以下缺點：
缺點一：含有抗營養因子
如較主要的三種抗營養因子：即胰蛋白酶抑制素、致甲狀腺腫素、凝血素，其中胰蛋白酶抑制因子，它能阻礙動物體內胰蛋白酶對豆類蛋白質的消化吸收，造成腹瀉，影響生長。所以，過去傳統的養殖戶，往往需要將豆渣煮熟之后，進行飼喂，這需要消耗大量的人工和燃料成本。
豆渣雖然含蛋白高，但動物可利用的能量卻很少
豆渣雖然含蛋白高，但動物可利用的能量卻很少，折干的豆渣消化能約2.05兆卡/千克（或8.58兆焦/千克），但這些消化能是指存在于豆渣蛋白碳骨架中的消化能，是不能或很難利用的。其利用效率遠遠低于玉米粉等能量飼料中的淀粉質能量，甚至造成對動物的傷害（傷肝傷脾），大量使用豆渣造成日糧的能量蛋白不平衡，蛋白過高，能量過低，大量過剩的蛋白進入后腸，脫氨分解，造成后腸PH上升，大腸桿菌滋生，腸毒素增加，內腸細胞脫水稀釋毒素，較終造成蛋白消化不良性腹瀉，同時也危害到動物健康水平。所以，喂豆渣必須搭配能量飼料來喂，以平衡營養。
收集的豆渣往往容易變質
收集的豆渣往往容易變質，由于含水量在，極易滋生雜菌甚至有害菌，變質變味，所以，傳統的養殖戶，收集的豆渣必須盡快煮熟喂完；
使用生物飼料發酵劑和生物酶分解劑發酵豆渣的好處：
①可徹底消除豆渣的三大抗營養因子，提升豆渣品質；
②可以適當平衡豆渣的能量蛋白比例，因為發酵降解了蛋白，提高了蛋白消化吸收率，并產生了小肽等免疫增強物質，蛋白自身的消化率的提高，相應減少了對能量的需求，同時，發酵分解了豆渣中的非淀粉多糖和纖維素等，產生單糖和低糖，相應增加了可消化能量值；
③發酵后的豆渣，只要密封好，幾乎可以永久保存，不會變質。